Lasiurus arequipae sp. nov. puede ser fácilmente diferenciable de otras especies del género Lasiurus de Sudamérica, utilizando la siguiente clave dicotómica (modificada de Díaz et al., 2016):
1 Coloración uniforme, amarillenta o rojiza; generalmente un premolar superior en cada lado................... 2
1´Coloración mezclada con pelos negros o grises, rojizos y amarillentos o marrones; al menos, 2 premolares superiores en un lado, el anterior muy pequeño y con desplazamiento medial......................................... 3
La coloración dorsal y ventral es olivácea amarillenta; uropatagio cubierto con pelos hasta la mitad en la parte dorsal..................................................................................... Lasiurus ega
2´La coloración dorsal y ventral es rojiza; uropatagio cubierto con pelos en la parte dorsal sólo hasta el primer tercio................................................................................. Lasiurus egregius
Coloración negra, puntas del pelaje dorsal y ventral negras; sólo presente en Brasil ................ Lasiurus ebenus
3´Coloración diferente, puntas del pelaje dorsal y ventral no son negras.................................... 4
Antebrazo mayor a 50 mm; coloración escarchada con predominio de pelos grises y amarillos...... Lasiurus cinereus
4´Antebrazo menor a 48 mm; coloración marrón oscura o rojiza.......................................... 5
Coloración marrón oscuro, solo presente en Brasil ....................................... Lasiurus castaneus
5´Coloración rojiza o acanelada..................................................................... 6
Antebrazo mayor a 45 mm ......................................................................... 7
6´Antebrazo menor a 44 mm ....................................................................... 8
Membrana alar negra.................................................................. Lasiurus atratus
7´Membrana alar negruzca pero moteada, coloración naranja opaco a lo largo de antebrazo y metacarpos................................................................................... Lasiurus arequipae sp. nov.
Coloración fuertemente rojiza pero no escarchada, uropatagio cubierto por pelos que se extienden más allá del borde.................................................................................... Lasiurus varius
8´Coloración rojiza brillante mezclada con gris, de apariencia escarchada; uropatagio totalmente cubierto por pelos, sin extenderse más allá del borde........................................................ Lasiurus blossevillii